Yra tam tikrų medžiagų apykaitos būdų, kuriuos galima apibrėžti, kad būtų galima nustatyti konkrečių molekulių konstrukciją.
Scichimo rūgšties kelias: antrinis metabolizmo kelias, kurio pirmtakas yra skichimo rūgštis, molekulė, turinti tas struktūrines ir chemines savybes, kurias galima rasti iš jo kilusiuose antriniuose metabolituose.
Scichimino rūgšties molekulę sudaro: 6 narių žiedas, 1 karboksirūgšties grupė ir 3 hidroksilo grupės. Tą pačią molekulinę struktūrą galima rasti iš jos kilusiuose antriniuose metabolituose, kurie iš tikrųjų vadinami rūgštis.skichimikas. Scichimino rūgštis atsiranda dėl dviejų skirtingų pirminių medžiagų apykaitos būdų tarpinių junginių:
eritrozio-4-fosfatas (3C): tarpinė tamsiosios fotosintezės fazė, anabolinis medžiagų apykaitos procesas;
fosfenolpiruvinė rūgštis (3C): glikolizės tarpinė medžiaga, katabolinis metabolinis procesas;
Todėl eritrozio-4-fosfatas + fosfenolpiruvinė rūgštis = skichimo rūgštis: pirmasis antrinių metabolinių kelių pirmtakas.
Ląstelė sintezuoja skichimo rūgštį, kai to reikia, arba kai dviejų pirminių tarpinių produktų kiekis yra toks didelis ir gali susikaupti; taip atsitinka, kai ląstelėje yra pakankamas ATP kiekis. lėtina pirminio katabolizmo ir anabolizmo reakcijas.
Malono ir mevalono rūgšties kelias: abu pirmtakai yra kilę iš acetilo CoA molekulės, todėl abu yra vieno kelio - acetato kelio. Acetil -CoA yra jungiamoji molekulė tarp glikolizės ir Krebso ciklo, todėl galime ją apibrėžti kaip tarpinę pirminis ląstelių metabolizmas.
Acetato grupė (grupė su dviem anglies atomais) + CoA (kofermentas A) = Acetyl CoA: molekulė, priklausanti pirminiam metabolizmui, kuri naudojama kaip biologinė statybinė medžiaga kuriant antrinius metabolitus.
Tada acetato kelias yra padalintas į malono rūgšties ir mevalono rūgšties kelią.Kofermentas A veikia kaip dviejų anglies vienetų pernešimas iš citoplazmos į ląstelės mitochondriją, kur vyksta Krebso ciklas. Du anglies vienetai, esant energijos pertekliui, gabenami kitur ir gali sudaryti pačius įvairiausius antrinius metabolitus; jų bendras bruožas yra lyginis anglies atomų skaičius, tarp kurių yra malono rūgštis (C4) ir mevalono rūgštis (C6).
Todėl skichimo rūgšties ir acetato metaboliniai keliai turi tikslią molekulinę struktūrą, leidžiančią lengvai nustatyti jų antrinius darinius. Dėl į alkaloidai, kurių architektūra yra įvairi, pirmtako identifikavimas nėra toks lengvas; kitaip tariant, nėra taip lengva klasifikuoti atskiras alkaloidų kategorijas, atsekant jas į vieną pirmtaką. Iš tikrųjų alkaloidai turi daugiau nei vieną pirmtakas, nes jie gaunami iš amino rūgščių (pirminių azoto junginių, kuriuos ląstelė naudoja antrinėms azoto molekulėms gaminti). Antriniai azoto metabolitai daugiausia yra alkaloidai, tačiau yra ir kitų molekulių, kurių sveikatos būklė yra prastesnė nei jų pačių glikozidai (esantys karčiuose migdoluose) ir β-cianosai (pigmentai)
Vienintelis cheminis elementas, jungiantis skirtingas alkaloidų kategorijas, yra azoto atomas, uždarytas į heterociklinį žiedą, arba bent jau azoto atomas su laisvo elektrono dubletu, kuris suteikia jiems pagrindines savybes; tas pats pagrindinis reaktyvumas, leidžiantis išgauti atskirus alkaloidus poslinkio būdu.
Mes galime tai apibendrinti sakydami angliavandenių kelias yra visų antrinių metabolitų sintezės pagrindastodėl apima visus anksčiau matytus metabolizmo kelius:
- acetatas yra visiško gliukozės molekulės griovimo produktas;
- aminorūgštys gaunamos metabolizuojant angliavandenius;
- šichimo rūgštis yra antrinių metabolitų, bet ir aromatinių aminorūgščių (fenilalanino, triptofano ir tirozino) pirmtakas;
-glikozidas yra antrinis metabolitas, sudarytas iš cukraus ir ne cukraus vieneto, vadinamo aglikonu, kuris, tikėtina, susidaro iš vieno iš apibendrintų metabolizmo būdų.
Visi biogenetiniai elementai, iš kurių atsiranda antriniai metabolitai, atsiranda dėl angliavandenių katabolizmo arba dėl jų anabolizmo. Šie cukrūs yra tie patys cukraus vienetai, kurie, susieti su aglikonu, sudaro glikozidus.
Acetato metabolinis kelias yra suskirstytas į tankų biogenetinį medį, kuriame yra visi antrinių metabolitų, kuriuos jis sukelia, pavadinimai. Skirtingi, priklausomai nuo pačios ląstelės poreikių:
- Krebso ciklas su galutine ATP (pirminio metabolizmo) gamyba;
- riebalų rūgščių β-oksidacija ir sintezė (pirminis metabolizmas);
- Malono arba malono rūgšties (4C), gautos sujungus dvi acetato molekules, ir mevalonato arba mevalono rūgšties (6C), susidarančios iš trijų acetato molekulių, sintezė. Ląstelė naudoja šias dvi molekules su lyginiu anglies atomų skaičiumi, kad sukurtų skirtingas molekulines kategorijas, susidedančias iš linijinių angliavandenilių vienetų grandinių, tokių kaip: riebalų rūgštys - naudojamos savo ruožtu gliceridams ir vaškams gaminti - terpenoidai, antrachinonai ir steroidai.
Kiti straipsniai tema „Biogenezė ir veikliųjų medžiagų savybės“
- Pirminis ir antrinis augalų metabolizmas
- Farmakognozija
- Scichimino rūgšties metabolinis kelias